Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms