Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RMDN1Q96DB5 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms