Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms