Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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