Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD1Q8NHV4 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms