Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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TMIEQ8NEW7 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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TMIEQ8NEW7 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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TMIEQ8NEW7 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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TMIEQ8NEW7 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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TMIEQ8NEW7 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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TMIEQ8NEW7 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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TMIEQ8NEW7 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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TMIEQ8NEW7 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TMIEQ8NEW7 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TMIEQ8NEW7 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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TMIEQ8NEW7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TMIEQ8NEW7 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
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