Protein–RNA interactions for Protein: Q8N431

RASGEF1C, Ras-GEF domain-containing family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1CQ8N431 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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RASGEF1CQ8N431 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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