Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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C9orf40Q8IXQ3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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C9orf40Q8IXQ3 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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C9orf40Q8IXQ3 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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