Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms