Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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ATG4DQ86TL0 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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ATG4DQ86TL0 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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ATG4DQ86TL0 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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ATG4DQ86TL0 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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ATG4DQ86TL0 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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ATG4DQ86TL0 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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ATG4DQ86TL0 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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ATG4DQ86TL0 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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