Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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USP34Q70CQ2 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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USP34Q70CQ2 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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