Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms