Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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