Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms