Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFWD3Q6PCD5 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFWD3Q6PCD5 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFWD3Q6PCD5 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFWD3Q6PCD5 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFWD3Q6PCD5 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFWD3Q6PCD5 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RFWD3Q6PCD5 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFWD3Q6PCD5 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RFWD3Q6PCD5 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFWD3Q6PCD5 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFWD3Q6PCD5 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFWD3Q6PCD5 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFWD3Q6PCD5 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFWD3Q6PCD5 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFWD3Q6PCD5 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms