Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.2 ms