Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms