Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms