Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms