Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms