Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms