Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 IL4-201ENST00000231449 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC068985.1-201ENST00000463297 703 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms