Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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