Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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PTPROQ16827 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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