Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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