Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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SIX1Q15475 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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SIX1Q15475 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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SIX1Q15475 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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SIX1Q15475 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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SIX1Q15475 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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SIX1Q15475 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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SIX1Q15475 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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SIX1Q15475 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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