Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EEA1Q15075 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms