Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms