Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms