Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms