Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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SSPNQ14714 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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SSPNQ14714 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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