Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX3Q13761 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX3Q13761 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX3Q13761 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RUNX3Q13761 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RUNX3Q13761 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX3Q13761 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX3Q13761 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX3Q13761 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX3Q13761 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX3Q13761 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX3Q13761 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RUNX3Q13761 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX3Q13761 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX3Q13761 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX3Q13761 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX3Q13761 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX3Q13761 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX3Q13761 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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RUNX3Q13761 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX3Q13761 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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RUNX3Q13761 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RUNX3Q13761 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RUNX3Q13761 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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RUNX3Q13761 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RUNX3Q13761 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RUNX3Q13761 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RUNX3Q13761 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RUNX3Q13761 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RUNX3Q13761 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RUNX3Q13761 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RUNX3Q13761 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RUNX3Q13761 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RUNX3Q13761 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RUNX3Q13761 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
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RUNX3Q13761 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RUNX3Q13761 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RUNX3Q13761 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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RUNX3Q13761 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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RUNX3Q13761 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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RUNX3Q13761 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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RUNX3Q13761 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RUNX3Q13761 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RUNX3Q13761 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RUNX3Q13761 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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