Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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