Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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