Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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