Protein–RNA interactions for Protein: Q13233

MAP3K1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K1Q13233 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP3K1Q13233 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP3K1Q13233 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms