Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RPA4Q13156 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RPA4Q13156 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RPA4Q13156 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RPA4Q13156 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RPA4Q13156 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RPA4Q13156 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RPA4Q13156 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RPA4Q13156 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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RPA4Q13156 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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RPA4Q13156 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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RPA4Q13156 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPA4Q13156 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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