Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms