Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms