Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms