Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR1Q08345 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms