Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms