Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms