Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FMODQ06828 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FMODQ06828 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FMODQ06828 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FMODQ06828 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FMODQ06828 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FMODQ06828 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FMODQ06828 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FMODQ06828 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FMODQ06828 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FMODQ06828 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FMODQ06828 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FMODQ06828 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms