Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms