Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms