Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms