Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms