Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms