Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms